Kurz vor dem 4. Juli, dem Independence Day, stürzen über den USA mehrere Flugzeuge auf mysteriöse Weise ab. Die Armee und die Flugsicherungseinheit FAA sehen ausländische Terroristen als Täter. Nur der FAA-Analyst Neil McCabe hat eine andere Theorie: Er vermutet, dass Computerhacker die Elektronik der Flugzeuge manipulieren und so zum Absturz bringen. In einem Rennen gegen die Zeit versucht er, zusammen mit seinem Partner Rudy die nächste Katastrophe zu verhindern.